São Francisco de Assis do Piauí possui uma economia baseada principalmente no comércio varejista, com destaque para minimercados, armazéns e lojas de vestuário que atendem às necessidades da população local. O município também apresenta expressiva presença de organizações comunitárias e políticas, refletindo o engajamento social da comunidade. A estrutura econômica é típica de pequenos municípios do interior piauiense, com atividades voltadas ao consumo doméstico e serviços essenciais para a população.