São João do Itaperiu é um município catarinense com economia diversificada, destacando-se pela construção civil e pela indústria têxtil, que inclui confecção de vestuário e prestação de serviços de facção. O transporte rodoviário de cargas representa um segmento importante na região, refletindo a vocação logística da localidade. O comércio varejista de artigos de vestuário complementa a cadeia produtiva têxtil, posicionando o município como um polo regional neste setor.