São João d'Aliança é um município de Goiás com economia diversificada, apresentando forte presença de comércio varejista e serviços pessoais que atendem à população local. A construção civil destaca-se como atividade importante, refletindo o desenvolvimento e a expansão da infraestrutura urbana do município. O comércio de alimentos e mercadorias em geral complementa o perfil econômico, consolidando a região como um centro de distribuição e prestação de serviços para as comunidades circunvizinhas.